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正殿的神龕上主要奉祀文昌帝君神位，配祀有制字聖人．紫陽夫子神位，大成至聖先師孔夫子神位．書院既有孔子神位，因此，也是集集每年際孔之所．正殿王並懸有（掌握文衡）．（立我蒸民）．（奎壁聯輝）的古匾． 　　神龕上的對聯明白揭示明新的宗旨，有兩對聯曰：（明列名垣耿耿天河星聚五，新登桂籍迢迢雲漢士升三），（明握文衡淳淳評章嚴古品，新增廟廟雍雍祀典重儒宗）．雙對聯的旨意誠如左右匾（承先啟後）．（明德新民）的大意一樣，揭櫫明新書院 明德新民德與傳承儒學宗師的宏願．

明新微醒學子
　　在正殿懸匾的對壁上，也高懸（文顯昌盛）．（崇尚盛德）兩匾，祈願文昌德被眾生，廣被文化的聖意．

門廳外有三對對聯，中門聯曰：（明德教人群不厭不倦功高日月，新民隆世運至正至公道冠乾坤）；右門聯曰：（明鑑丹心袞貶萬方從聖道，新機靈腕琢磨諸子拜儒宗）；左門聯曰：（明型垂世典千古均遵聖道，新界慕評章萬方皆養文宗．）
　　正殿外通往左．右側廊的圓門窗櫺上書有（斯文）．（吾道）的大字，恰與門外左．右橫聯上（斯文為萬世表，吾道在南方的旨意相輝映．
　　太右朱門上書有（光開紫極，筆點青雲）．（至衡光燦，紫極權尊）的題字，頗有祈人能掌握文衡．金榜題名的旨意；中門上則有聾地啞的彩繪晝像，作為文昌帝君之護衛，以警示今人求取功名必由正途．